بررسی اسپکتروسکوپی و مدل سازی مولکولی برهمکنش ونکومایسین با dna
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی اصفهان - دانشکده شیمی
- نویسنده آرمان خالدی
- استاد راهنما تقی خیامیان
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1393
چکیده
در این پایان نامه به مطالعه تجربی و تئوری بررسی برهمکنش داروی ونکومایسین با dna پرداخته شد. ونکومایسین یک آنتی بیوتیک گلیکوپپتیدی است که با اثر بر روی ساخت دیواره سلولی، برای درمان عفونت های باکتریایی گرم مثبت استفاده می شود. تغییرات طیف حاصل از روش های اسپکتروسکوپی جذب و فلوئورسانس، نمایانگر برهمکنش ونکومایسین با dna می باشد. ثابت اتصال پیوندی(kb) با استفاده از تکنیک جذب 5^10*0.161 و ثابت تقویت دینامیکی(kd)، با استفاده از روش فلوئورسانس 5^10*7.2 به دست آمد. نسبت استوکیومتری اتصال کمپلکس ونکومایسین با dna، با روش تجزیه تغییر مداوم (منحنی جاب) بررسی شد که نسبت 1:1 به¬دست آمد. از روش های محاسباتی و مدل سازی هم برای بررسی سایت های اتصال دارو و dna، استفاده شد و مقدار ثابت اتصال بین دارو و dna، برابر 5^10*5.26 به دست آمد. نتایج حاصل از محاسبات تجربی و تئوری تطابق خوبی را نشان می دهد. مطالعه نوع برهمکنش با استفاده از تکنیک فلوئورسانس، ویسکومتری و داکینگ مولکولی انجام شد که هر سه روش، نحوه برهمکنش اینترکلیشن را نشان دادند. شبیه سازی دینامیک مولکولی بر روی کمپلکس ونکومایسین-dna انجام شد و نتایج حاصل نشان دادکه برهمکنش های هیدروفوبیک حذف و تعداد پیوندهای هیدروژنی نسبت به حالت قبل از شبیه سازی کاهش پیدا کرد. در پایان، سایت اتصال و نوع برهمکنش داروی ونکومایسین با dna قبل و بعد از شبیه سازی دینامیک مولکولی مقایسه شد.
منابع مشابه
مطالعه اسپکتروسکوپی برهمکنش نیل بلو با نوکلئوتیدهای سنتزی و dna
برهمکنش نیل بلو با پلی نوکلئوتیدهای سنتزی، پلی(گوانین- سیتوزین)، پلی(آدنین- تیمین) و dna غده تیموس گوساله در بافر فسفات 5/2 میلی مولار با ph 20/7 توسط اسپکتروسکوپی جذب uv-vis و فلورسانس بررسی شده است. در طیف جذبی رنگینه کاهش شدید جذب به همراه جابجایی به سمت طول موج های کوتاهتر و خاموشی در طیف فلورسانس مشاهده گردید که بیانگر پیوند قوی نیل بلو با پلی نوکلئوتیدها و dna می باشد. مقادیر تمایل پیوند ...
مطالعات اسپکتروسکوپی برهمکنش لیزوزیم و نانوذره اکسید روی
چکیده جذب پروتئین درسطح غیرآلی، منجر به تغییرات ساختاری و عملکردی می‌گردد که وابسته به طبیعت پروتئین جذب شده و خصوصیات فیزیکوشیمیایی سطح غیرآلی دارد. لیزوزیم سفیده تخم مرغ (E.C 3.2.1.17) با وزن مولکولی 6/14 کیلودالتون، پروتئین کروی کوچکی متشکل از 129 اسید آمینه با چهار پیوند دی سولفید است. هدف از این تحقیق مطالعه اثر نانوذره اکسید روی بر پایداری و ساختار آنزیم لیزوزیم سفیده تخم مرغ از طریق تکنی...
متن کاملبررسی برهمکنش های لانتانیدها با dna های کوتاه زنجیر به روشهای الکتروشیمیایی و اسپکتروسکوپی
چکیده در این مطالعه ابتدا برهمکنش بین عناصر لانتانید با dnaهای کوتاه زنجیر (ssdna) مورد بررسی قرار گرفت.بررسی ویژگی های بیوشیمیایی لانتانیدها هنگامی مورد توجه قرار گرفت که مشخص گردید به دلیل تشابه شعاع یونیla3+با یون ca2+، این عنصر می تواند جانشین یون کلسیم در فرآیندهای بیولوژیکی شود. در قسمت بعد،برای اولین بار ویژگی های الکتروشیمیایی تعدادی از لانتانیدهای الکتروفعال نیز مورد بررسی قرار گرفت...
15 صفحه اولشبیه سازی دینامیک مولکولی برهمکنش داروی ضد سرطان پاکلیتاکسل با غشای سلولی: بررسی تغییرات انرژی واندروالسی و فاصله مرکز جرم
به دلیل افزایش روزافزون سرطان و تولید داروی جدید در درمان آن در این تحقیق به بررسی برهمکنش داروی جدید ضد سرطان آبگریز پاکلیتاکسل بر روی غشای سلولی با استفاده از ابزارهای محاسباتی پرداخته شده است. از نرم افزار دینامیک مولکولی NAMD و همچنین، نرم افزار VMD برای آماده سازی فایل های ورودی که از بانک داده های پروتیین گرفته شده بودند˛ جهت شبیه سازی و همچنین تحلیل و بررسی داده های خروجی استفاده شده است...
متن کاملمطالعه برهمکنش نانولوله کربنی دو‌دیواره با هورمون محرکه فولیکولی (FSH) به کمک شبیه سازی دینامیک مولکولی
برهمکنش نانوذراتی همچون نانولوله‌های کربنی با درشت‌ملکول‌های زیستی به علت کاربرد گسترده آنها در حوزه‌های مختلف از جمله شناسایی و از بین بردن سلول‌های سرطانی، مهندسی بافت، بلوری کردن پروتئین‌ها، ساخت راکتورها و همچنین حس‌گرهای زیستی اهمیت زیادی پیدا کرده است. باور بر این است که نانولوله‌های کربنی از طریق برهمکنش با پروتئین‌ها (نانوذرات-پروتئین کرونا) می‌توانند اثرات زیستی مهمی در بدن داشته باشند...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی اصفهان - دانشکده شیمی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023